Windows ile alakalı konuşuyoruz sanırım. Uygulamayı koymanız gereken yer C:\Users\User\AppData\Roaming\Microsoft\Windows\Start Menu\Programs\Startup.
Kayıt defteri ile de yapılabiliyordu ama şimdi hatırlamıyorum.
Buldum. Kullanmanız gereken anahtarlar burada anlatılmış:
https://www.akadia.com/services/windows_registry.html
https://docs.microsoft.com/en-us/windows/win32/setupapi/run-and-runonce-registry-keys
Kayıt defterine erişmek için de winreg var.